Program Pendidikan adalah aktivitas yang memuat kebulatan pengalaman belajar dalam ilmu pengetahuan, ketrampilan dan sikap yang dilaksanakan oleh masing-masing jurusan. Pada saat ini Universitas Syiah Kuala membuka 10 fakultas diantaranya:
1. Fakultas Ekonomi
2. Fakultas Kedokteran Hewan
3. Fakultas Hukum
4. Fakultas Teknik
5. Fakultas Pertanian
6. Fakultas Keguruan dan Ilmu Pendidikan
7. Fakultas Kedokteran
8. Fakultas Matematika dan Pengetahuan Alam
9. Fakultas Ilmu Sosial dan Politik
10. Fakultas Kelautan dan Perikanan

Program Pendidikan terdiri atas:
1. Program Diploma (D3)
2. Program Sarjana (S1)
3. Program Pasca Sarjana (S2)
4. Program Doktor (S3)